В 1392 году, за несколько десятилетий до открытия монастыря на склонах нынешней Святой горы была лесная чаща. Некий крестьянин И. Дементьев заготавливал там древесину. Одно из деревьев, упав, обнажило вход под землю, и обнаружились написанные слова: «Богом сданные пещеры». Кто сделал эту пометку неизвестно до сих пор. Согласно преданию ранее здесь обитали иноки, бежавшие с южных краев от преследований во времена татаро-монгольского ига.
Впоследствии один монах тайком пытался стереть надпись у пещер, но она необъяснимым образом появлялась снова. Это чудо Господь даровал людям для укрепления веры. Сегодня монастырские пещеры представляют собой место захоронения, состоящее из семи улиц, где погребены не только иноки, но и преставившиеся здесь паломники, благочестивые миряне, воинство, защищавшее монастырь.
Расцвет обители пришелся на времена преподобномученика Корнилия (1501 – 1570), который открыл Надвратную и увеличил Успенскую церковь. Этот игумен превратил монастырь в неприступную крепость, выдержавшую осаду польского короля Стефания, натиск шведов, посягательства венгерских отрядов завоевателей. Тогда же в обители начали работать гончарные, литейные, иконописные мастерские, а также библиотека, собиравшая на хранение богослужебные и светские рукописи.
За многовековую историю Печоры никогда не закрывались, несмотря на войны, гонения, препятствия, создаваемые властями. Духовная жизнь здесь всегда поддерживалась старцами – величайшими праведниками своей эпохи. Эти люди, не просто священнослужители, преисполненные любви к Господу и окружающим, а благодатные избранники, способные узреть и передать вопрошающему Божью волю!